軟硬兼?zhèn)洹⒏哔|(zhì)高量的一站式解決方案
21世紀(jì)以來(lái),以基因組學(xué)為基礎(chǔ)的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)發(fā)展迅猛,全球各國(guó)逐漸啟動(dòng)萬(wàn)人級(jí)別基因組計(jì)劃,百萬(wàn)級(jí)別人口基因組計(jì)劃為癌癥、罕見(jiàn)病等臨床應(yīng)用帶來(lái)突破口,精準(zhǔn)醫(yī)療大數(shù)據(jù)時(shí)代加速到來(lái),海量數(shù)據(jù)的產(chǎn)生對(duì)匹配的軟硬件設(shè)備、數(shù)據(jù)安全、項(xiàng)目管理等提出了巨大挑戰(zhàn)。
華大智造本次所發(fā)布的百萬(wàn)級(jí)別基因組整體解決方案直面行業(yè)挑戰(zhàn)及需求,依托其獨(dú)有的DNBSEQ™ 測(cè)序技術(shù)和stLFR長(zhǎng)片段建庫(kù)技術(shù),細(xì)致周全、多次實(shí)踐完善的全周期信息管理系統(tǒng),實(shí)現(xiàn)從樣本處理到報(bào)告出具全流程標(biāo)準(zhǔn)化、高質(zhì)量運(yùn)作。從硬件上看,整套解決方案包括自動(dòng)化樣本前處理系統(tǒng)、全自動(dòng)化建庫(kù)系統(tǒng)、日通量可達(dá)Tb級(jí)別測(cè)序儀、每年可處理EB級(jí)別的數(shù)據(jù)處理平臺(tái)。
全自動(dòng)化高效運(yùn)作,Tb級(jí)別測(cè)序儀全面發(fā)力
自動(dòng)化樣本處理系統(tǒng)是該解決方案的核心之一,百萬(wàn)級(jí)別基因組測(cè)序項(xiàng)目實(shí)地運(yùn)作,測(cè)序前樣本處理超大樣本量完全無(wú)法依托人工操作完成。
本次華大智造發(fā)布的自動(dòng)化樣本處理系統(tǒng)主要分為兩部分,第一部分為全血預(yù)處理系統(tǒng),該系統(tǒng)占地空間僅為15㎡,輔助一名操作員即可滿足操作需求。且實(shí)現(xiàn)滾動(dòng)上樣,完全無(wú)需人工干預(yù),全年年產(chǎn)量可高達(dá)60萬(wàn)例樣本;第二個(gè)重要系統(tǒng)為全自動(dòng)建庫(kù)系統(tǒng),該系統(tǒng)為全球首套超高通量文庫(kù)構(gòu)建系統(tǒng)。占地面積大約為100㎡,同時(shí)輔助2名操作員即可滿足生產(chǎn)需求;可全天24小時(shí)無(wú)休運(yùn)轉(zhuǎn),全程無(wú)需人工干預(yù),全年年產(chǎn)量可高達(dá)50萬(wàn)例樣本。
測(cè)序設(shè)備方面,此前華大智造超高通量測(cè)序儀DNBSEQ-T7從數(shù)據(jù)產(chǎn)量及質(zhì)量已有穩(wěn)定、超預(yù)期表現(xiàn)。在此方案中,華大智造DNBSEQ-T系列測(cè)序儀每年測(cè)序樣本量可達(dá)60萬(wàn)到80萬(wàn)人次,為百萬(wàn)級(jí)別基因組項(xiàng)目提供基礎(chǔ)設(shè)備支撐。
全周期信息管理,一站式解決數(shù)據(jù)問(wèn)題
該方案的另一亮點(diǎn)是包含一站式的數(shù)據(jù)處理平臺(tái),具備一站式、高性能、自動(dòng)化、低成本、安全等若干優(yōu)點(diǎn),充分體現(xiàn)“IT+BT”的融合理念,賦能生命科技生態(tài)系統(tǒng)。
大量數(shù)據(jù)測(cè)序完成后,數(shù)據(jù)分析環(huán)節(jié)是重中之重,該方案將展示其EB級(jí)的容量擴(kuò)展及數(shù)據(jù)治理、計(jì)算及存儲(chǔ)能力,每年能夠完成10萬(wàn)到100萬(wàn)樣本量分析;此外,由于數(shù)據(jù)量龐雜,信息流傳遞的過(guò)程非常復(fù)雜,該方案融合實(shí)驗(yàn)室管理系統(tǒng)提供端到端的解決方案,易實(shí)施部署,全程可追溯、可查詢,解決管理難題;基于基因數(shù)據(jù)安全隱私問(wèn)題,華大創(chuàng)新的區(qū)塊鏈技術(shù)將提供最大化保障;從成本上看,方案采用存儲(chǔ)分層優(yōu)化管理,并根據(jù)基因數(shù)據(jù)及算法特點(diǎn),最大化利用存儲(chǔ)資源及計(jì)算資源。
基因科技未來(lái)突破發(fā)展路徑,邁進(jìn)“人人基因組”時(shí)代
如果將基因科技未來(lái)突破發(fā)展路徑生動(dòng)類比為一把剪刀,剪刀的一邊代表測(cè)序成本的下降,另外一邊代表測(cè)序通量的提升,一升一降所形成的“大剪刀”,代表著基因科技未來(lái)突破發(fā)展的路徑。要使得生命時(shí)代的“剪刀差”來(lái)得更快,基因測(cè)序成本降低和全基因組檢測(cè)覆蓋度是兩個(gè)重要因素。
在樣本量超大的前提下,從收到樣本到出具報(bào)告,每一個(gè)環(huán)節(jié)的問(wèn)題都可能影響最終結(jié)果。只有標(biāo)準(zhǔn)化、信息化的運(yùn)作,盡量減少人工干預(yù),提升自動(dòng)化程度,才能最大程度保證大項(xiàng)目高效、優(yōu)質(zhì)完成,進(jìn)一步為臨床應(yīng)用提供高精度、可靠的基因組數(shù)據(jù)信息。
華大智造百萬(wàn)基因組整體解決方案在整合自身軟硬件資源前提下,拓展技術(shù)邊界,為大人群基因組項(xiàng)目提供了一套切實(shí)可行、優(yōu)質(zhì)完備的整體解決方案,加速邁進(jìn)“人人基因組”時(shí)代步伐。