該院將建成為廣州從事臺灣問題綜合研究、政策咨詢和對外交流的重要學術機構，其基本目標是“加強臺灣研究，服務對臺工作”。

　　廣州大學校長庾建設表示，廣州大學對臺交流合作的歷史悠久、基礎雄厚、成果卓著，至今已與臺灣屏東教育大學、淡江大學等10多所高校及科研機構開展了合作交流。

　　據悉，臺灣研究院目前整合了廣州大學的兩岸合作研究機構，包括農村治理研究中心、教育政策研究中心、臺資企業研究中心、兩岸婚姻家庭研究中心和民間宗教事務研究中心等。