目前在許多行業中大量運用到潔凈技術，尤其是醫院、藥廠、醫療設備、檢驗檢疫、食品加工和實驗動物等行業，都有大量的新建和改建凈化工程。在凈化工程設計施工過程中，有以下幾點常見缺陷需要大家警惕：
1、設計人員知識結構缺陷
設計人員不僅應該對自己所選用的設備有全面的了解，還應該對所有能對系統泄漏量產生影響的因素，包括施工單位的施工水平有所了解，對送風適當地留有一定的設計余量是非常必要的。
2、回風系統中的問題
在壓力控制方面，回風系統的設計很重要，特別是回風口的計算。要合理的布置回風口，應全面的考慮凈化系統的綜合性能。回風系統的設置不單要把回風引回循環機組，還要參與系統壓力的控制。設計中突出的問題是片面強調房間內的氣流分布均勻，從而盲目的增加回風口的數量，大量使用相同尺寸的回風口，而不考慮采取相應控制措施。由于回風口面積的增大，無形中增加了回風量的控制難度，易導致正壓無法形成。
3、排風系統中的問題
設置排風系統的目的大致可以分成兩種：一是要滿足工藝要求，排出變質的氣體(如高含塵及有機物、高溫高濕氣體)；二是要滿足系統要求，即補充新風。排風量的計算是一個比較復雜的過程，把它簡單化了就不會達到預期的效果。在實際工作中往往最容易忽略的就是系統中還存在泄漏量問題，負壓系統特別是在一些施工質量較差的工程上這個問題尤為突出。
排風系統的設計應該側重于它的合理性。滿足工藝要求的排風，排風位置的選擇很重要，要科學設置排泄點，有效減少排風風量是排風系統設計的宗旨。滿足新風量的要求主要是通過在系統中加一些排風實現；但不能一概而論，當建筑物和通風系統的泄漏量足夠大時，再設置排風就是多余的了，在設計時要對這方面有細致的了解。
4、新風系統中的問題
計算新風量時不能忽略整個系統的泄漏量問題，理論計算值和實際測定值的差別有時相差很懸殊，這和工程的各個環節有關。現在許多工程都大量使用集中新風系統，一個新風機組要供應幾個甚至十幾個循環機組的新風，如果每個循環系統都有風量選用誤差，那新風機組在風量選用上的誤差就會相當大。另外，有些工程在新風口和新風管道的設計上尺寸偏小；有些業主限制了建筑物上開洞的尺寸，這樣在設計時要采取補救措施，不應在發現新風量不足時再想辦法解決。
