《管理辦法》面向“20+8”產業集群，圍繞產業鏈布局創新鏈，著力加強基礎研究和應用研究，強化企業科技創新主體地位，推進產學研高效協同。

按照國家建設高水平科學與工程研究類科技創新基地要求，《管理辦法》提出加強頂層設計，明確各級重點實驗室的功能定位和目標任務，打造層級分明的“全國重點實驗室-廣東省重點實驗室-深圳市重點實驗室”梯隊建設體系。

《管理辦法》提出注重原始創新，聚集領軍人才，增強各級重點實驗室持續創新活力，促進重大原創成果產出，提升影響力。《管理辦法》還提出通過完善日常管理和動態評估機制，推動重點實驗室持續建設和產出成果，并建立多元投入機制，優化財政資金投入和管理機制，鼓勵依托建設單位持續投入，提升服務保障能力。